Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.3 ms