Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATRQ13535 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATRQ13535 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
ATRQ13535 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATRQ13535 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATRQ13535 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATRQ13535 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATRQ13535 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATRQ13535 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATRQ13535 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATRQ13535 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRQ13535 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRQ13535 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRQ13535 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRQ13535 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRQ13535 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRQ13535 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRQ13535 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRQ13535 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRQ13535 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRQ13535 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRQ13535 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRQ13535 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRQ13535 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRQ13535 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRQ13535 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRQ13535 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRQ13535 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRQ13535 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRQ13535 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATRQ13535 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATRQ13535 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATRQ13535 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATRQ13535 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATRQ13535 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATRQ13535 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATRQ13535 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
ATRQ13535 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATRQ13535 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATRQ13535 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
ATRQ13535 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATRQ13535 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATRQ13535 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATRQ13535 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATRQ13535 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATRQ13535 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
ATRQ13535 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATRQ13535 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATRQ13535 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
ATRQ13535 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATRQ13535 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
ATRQ13535 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATRQ13535 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
ATRQ13535 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATRQ13535 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATRQ13535 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC0.31□□□□□ -2.36
ATRQ13535 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATRQ13535 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATRQ13535 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATRQ13535 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATRQ13535 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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