Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
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