Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms