Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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NR1H3Q13133 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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NR1H3Q13133 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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NR1H3Q13133 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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NR1H3Q13133 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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NR1H3Q13133 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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NR1H3Q13133 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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NR1H3Q13133 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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NR1H3Q13133 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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NR1H3Q13133 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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