Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
DUSP4Q13115 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
DUSP4Q13115 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
DUSP4Q13115 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
DUSP4Q13115 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
DUSP4Q13115 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
DUSP4Q13115 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
DUSP4Q13115 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
DUSP4Q13115 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
DUSP4Q13115 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
DUSP4Q13115 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
DUSP4Q13115 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
DUSP4Q13115 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
DUSP4Q13115 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
DUSP4Q13115 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
DUSP4Q13115 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
DUSP4Q13115 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
DUSP4Q13115 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
DUSP4Q13115 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms