Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTP4A2Q12974 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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