Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC0.36□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC0.34□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
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BPTFQ12830 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
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BPTFQ12830 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC0.33□□□□□ -2.36
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BPTFQ12830 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
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BPTFQ12830 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
BPTFQ12830 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
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