Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRDP23468 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.8 ms