Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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PTPRAP18433 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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PTPRAP18433 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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PTPRAP18433 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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