Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y548

YIPF1, Protein YIPF1, humanhuman

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF1Q9Y548 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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YIPF1Q9Y548 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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YIPF1Q9Y548 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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YIPF1Q9Y548 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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YIPF1Q9Y548 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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YIPF1Q9Y548 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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YIPF1Q9Y548 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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YIPF1Q9Y548 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
YIPF1Q9Y548 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
YIPF1Q9Y548 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
YIPF1Q9Y548 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
YIPF1Q9Y548 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
YIPF1Q9Y548 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
YIPF1Q9Y548 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
YIPF1Q9Y548 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
YIPF1Q9Y548 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
YIPF1Q9Y548 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
YIPF1Q9Y548 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
YIPF1Q9Y548 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
YIPF1Q9Y548 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
YIPF1Q9Y548 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
YIPF1Q9Y548 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
YIPF1Q9Y548 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
YIPF1Q9Y548 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
YIPF1Q9Y548 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
YIPF1Q9Y548 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
YIPF1Q9Y548 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
YIPF1Q9Y548 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
YIPF1Q9Y548 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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