Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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TRERF1Q96PN7 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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TRERF1Q96PN7 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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TRERF1Q96PN7 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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TRERF1Q96PN7 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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TRERF1Q96PN7 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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TRERF1Q96PN7 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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TRERF1Q96PN7 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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TRERF1Q96PN7 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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