Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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