Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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