Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC1.23□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.23□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms