Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTF1Q16619 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms