Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
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CNGA3Q16281 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
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CNGA3Q16281 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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