Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC6Q16204 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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