Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
USF2Q15853 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
USF2Q15853 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
USF2Q15853 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
USF2Q15853 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
USF2Q15853 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
USF2Q15853 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
USF2Q15853 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
USF2Q15853 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
USF2Q15853 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
USF2Q15853 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
USF2Q15853 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
USF2Q15853 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
USF2Q15853 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
USF2Q15853 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
USF2Q15853 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
USF2Q15853 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
USF2Q15853 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
USF2Q15853 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
USF2Q15853 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
USF2Q15853 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
USF2Q15853 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
USF2Q15853 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
USF2Q15853 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USF2Q15853 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USF2Q15853 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USF2Q15853 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USF2Q15853 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USF2Q15853 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
USF2Q15853 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USF2Q15853 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
USF2Q15853 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
USF2Q15853 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USF2Q15853 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
USF2Q15853 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
USF2Q15853 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
USF2Q15853 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USF2Q15853 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
USF2Q15853 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USF2Q15853 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
USF2Q15853 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
USF2Q15853 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USF2Q15853 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
USF2Q15853 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
USF2Q15853 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USF2Q15853 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
USF2Q15853 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USF2Q15853 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USF2Q15853 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USF2Q15853 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USF2Q15853 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USF2Q15853 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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