Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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