Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
BRD3Q15059 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms