Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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NFIXQ14938 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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NFIXQ14938 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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NFIXQ14938 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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