Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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