Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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COL4A6Q14031 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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COL4A6Q14031 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
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COL4A6Q14031 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
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COL4A6Q14031 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC0.64□□□□□ -2.31
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COL4A6Q14031 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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COL4A6Q14031 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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COL4A6Q14031 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
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COL4A6Q14031 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
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COL4A6Q14031 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
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COL4A6Q14031 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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COL4A6Q14031 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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COL4A6Q14031 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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COL4A6Q14031 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.6□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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