Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE7AQ13946 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms