Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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DDX39BQ13838 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
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DDX39BQ13838 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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DDX39BQ13838 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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DDX39BQ13838 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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DDX39BQ13838 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
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DDX39BQ13838 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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DDX39BQ13838 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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