Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
FHL3Q13643 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms