Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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CDH18Q13634 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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CDH18Q13634 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
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