Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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