Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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