Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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