Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms