Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
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SKP2Q13309 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
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SKP2Q13309 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
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SKP2Q13309 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
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SKP2Q13309 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC1.41□□□□□ -2.18
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SKP2Q13309 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
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SKP2Q13309 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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