Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms