Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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SRSF6Q13247 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
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SRSF6Q13247 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SRSF6Q13247 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
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SRSF6Q13247 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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