Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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IFT88Q13099 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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IFT88Q13099 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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IFT88Q13099 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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IFT88Q13099 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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IFT88Q13099 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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IFT88Q13099 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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