Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
GRIN2AQ12879 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC0.95□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GRIN2AQ12879 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms