Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIAQ12857 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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