Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CACNB1Q02641 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CACNB1Q02641 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CACNB1Q02641 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CACNB1Q02641 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CACNB1Q02641 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CACNB1Q02641 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CACNB1Q02641 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNB1Q02641 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNB1Q02641 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNB1Q02641 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNB1Q02641 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNB1Q02641 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNB1Q02641 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNB1Q02641 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNB1Q02641 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNB1Q02641 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNB1Q02641 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNB1Q02641 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms