Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms