Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF4Q9NR80 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms