Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UHRF1Q96T88 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UHRF1Q96T88 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UHRF1Q96T88 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UHRF1Q96T88 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UHRF1Q96T88 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UHRF1Q96T88 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UHRF1Q96T88 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UHRF1Q96T88 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UHRF1Q96T88 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UHRF1Q96T88 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UHRF1Q96T88 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UHRF1Q96T88 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UHRF1Q96T88 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
UHRF1Q96T88 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UHRF1Q96T88 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UHRF1Q96T88 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UHRF1Q96T88 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
UHRF1Q96T88 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
UHRF1Q96T88 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UHRF1Q96T88 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
UHRF1Q96T88 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
UHRF1Q96T88 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
UHRF1Q96T88 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
UHRF1Q96T88 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
UHRF1Q96T88 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
UHRF1Q96T88 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
UHRF1Q96T88 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
UHRF1Q96T88 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
UHRF1Q96T88 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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UHRF1Q96T88 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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UHRF1Q96T88 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
UHRF1Q96T88 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
UHRF1Q96T88 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
UHRF1Q96T88 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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UHRF1Q96T88 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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UHRF1Q96T88 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
UHRF1Q96T88 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
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UHRF1Q96T88 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
UHRF1Q96T88 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
UHRF1Q96T88 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
UHRF1Q96T88 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
UHRF1Q96T88 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
UHRF1Q96T88 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
UHRF1Q96T88 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
UHRF1Q96T88 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
UHRF1Q96T88 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
UHRF1Q96T88 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
UHRF1Q96T88 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
UHRF1Q96T88 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
UHRF1Q96T88 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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