Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDRT15Q96T59 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.6 ms