Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
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