Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TPRNQ4KMQ1 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms