Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.6 ms