Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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PTPROQ16827 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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PTPROQ16827 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
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PTPROQ16827 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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PTPROQ16827 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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PTPROQ16827 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
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PTPROQ16827 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
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PTPROQ16827 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
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PTPROQ16827 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
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PTPROQ16827 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
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