Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms