Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ZIC1Q15915 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms