Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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